我院学生首次参加CBC数据挑战赛并荣获二等奖

CBC数据挑战赛是由中国计算机学会生物信息学专委会筹办的生物信息学领域的科研竞赛，致力于围绕生物信息领域的热点、难点问题，提出具有创新性的解决方案，助力人工智能在生物信息领域的应用，推动数字化医疗的发展，在国内生物信息学领域颇具影响力。我院2020级本科生耿宗依与2021级本科生王丛、农学院2020级本科生张诗瀚、臧一介组队，在覃静老师的指导下荣获CBC2022数据挑战赛二等奖。

我院学生系首次参加此项比赛，参赛同学在没有计算机基础的情况下，凭借着对生物信息学极大的热情，积极学习相关专业知识；在覃静老师的指导下，他们利用二代测序比对技术解决三代测序比对存在的问题，在比赛中脱颖而出获得奖项。参赛学生从多种序列比对方法中获得灵感，对三代测序序列进行切分，将三代测序数据中长而错误率高的序列拆解成可进行快速序列比对的短序列，从而能够利用目前成熟且高效的二代测序比对技术迅速找到短序列在基因组上的位置，然后再将锚定到的基因组区域序列与原始的三代测序序列进行精细比对。由于这一方法只需要部分切分得到的短序列能比对到基因组，就可以快速锚定基因组的位置，这在一定程度上改进了三代测序比对中因序列错误率高而导致的比对准确率低和因序列太长而引起的耗时长的问题。

覃静副教授、博士生导师

参赛过程中，指导老师覃静副教授对学生进行了悉心指导，给予了许多帮助，积极引导学生关注、学习该领域的新技术和新方法；当学生遇到瓶颈时，能够给出新思路。覃静副教授长期从事生物信息学分析方法的研究及其在生物医药问题中的应用，曾开发多个针对基因调控机制研究的分析工具与方法，应用于探索细胞命运转换、组织发育、免疫应答等过程与癌症、心脏病、肾病等疾病中基因调控机制的研究，并从疾病机制中探索潜在的创新药物。

CBC数据挑战赛是由国内计算机领域生物信息学方向最具影响力的会议——中国计算机学会生物信息学会议（CBC）发起的生物信息学领域的科研竞赛，自2021年创建以来已成功举办三届。三届赛事先后围绕“蛋白质同源性搜索”、“蛋白质BERT预训练”、“蛋白质预训练”、“三代测序比对软件”、“内窥镜计算机视觉”、“蛋白质超家族分类”六个生物信息学专题提出命题，每届每个赛道仅产生1个一等奖和5个二等奖。

通过学院积极搭建的信息科研平台和老师的悉心指导，参赛学生在面对新领域时，积极应对挑战，在比赛中充分发挥了自己的潜力和才华，最终取得佳绩。参赛队员们的综合能力在此过程中得到了很大提升，将鼓舞更多本科生参与到科研中，以赛代练，以赛促学；学院也将继续致力于培养交叉学科复合型人才，期待我院学生在科研训练中再创佳绩！